市面上普遍的醫用口罩無論標示「未滅菌」還是「滅菌」，其前期製成方式與規格都相同，相同規格的口罩中，防護力也是相同的。
未滅菌醫用口罩是市面上最常見的規格，藥妝店最常看到的就是標示「未滅菌」，未滅菌醫用口罩表面雖然含有一定量的細菌存在，但也是在嚴格的標準及環境下生產的口罩，即使存在細菌但也是不會造成致病危害的，未滅菌醫用口罩是足夠安全滿足日常公眾的防護需求，無論是戶外甚至進入密集或密閉的公共場所使用都是符合使用規範的。
然而滅菌口罩需要經過環氧乙烷滅菌，生產出來以後需3-14天的解析期(讓環氧乙烷殘留量降到10ug/g下)，才能上市銷售，對於檢驗標準和要求更為嚴格。主要是因為在例如ICU(加護病房)、手術室等需嚴格控制微生物環境場所使用。
以保證進入該場所的東西都是無菌的，才不會引發病患或該導致場所被其它細菌感染。
**補充說明：
目前醫用口罩的滅菌都是採用環氧乙烷EO滅菌，環氧乙烷屬於易燃易爆且為致癌物，所以經過這道滅菌程序以後，需3-14天的解析期(讓環氧乙烷殘留量降到10ug/g下)，才能上市銷售。
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